持續(xù)在世界各地進(jìn)行修業(yè)之旅的小智（松本梨香 配音）、小剛（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音），歷經(jīng)長途跋涉終于來到了位于山谷丘陵處的目的地阿拉莫斯鎮(zhèn)。小鎮(zhèn)上聳立著象征時(shí)間與空間的時(shí)光之塔，新一輪的神奇寶貝競(jìng)賽將在塔的下方舉行。小智一行走錯(cuò)了路，卻由此結(jié)識(shí)當(dāng)?shù)氐拿利惻惤z（加藤ローサ 配音）。緊張的戰(zhàn)斗與快樂的游玩，卻未察覺危險(xiǎn)正悄悄逼進(jìn)。小智遭到噩夢(mèng)精靈達(dá)庫萊伊的襲擊，雖然達(dá)庫萊伊被當(dāng)?shù)厮腥擞憛?，但是它似乎想將某種危險(xiǎn)、恐怖的信息及時(shí)傳給小智一行，關(guān)于時(shí)空之塔的秘密即將揭開…… 本片為神奇寶貝系列第十部電影劇場(chǎng)版。