在晴朗明媚的一天，羊村正舉行防御系統(tǒng)揭幕儀式，這是慢羊羊村長的最新發(fā)明，該系統(tǒng)可以抵制上千伏的電壓。誰知這時(shí)灰太狼突然出現(xiàn)攪局，不久前他發(fā)明了羊味罐頭，由此成為當(dāng)今最炙手可熱的科學(xué)家，可是沒能抓到小羊依然是他心中隱隱的傷痛。灰太狼操縱天氣控制器與羊羊特工隊(duì)展開殊死搏斗。受傷的喜羊羊偶然結(jié)識了熊貓旺財(cái)，而對方的真實(shí)身份是滅絕了許久的蛇。受挫的灰太狼專心升級天氣控制器，卻忽略了老婆和灰灰的感受，而他的失誤也導(dǎo)致天氣控制器失控。危難時(shí)刻，青青草原的各位意外發(fā)現(xiàn)久遠(yuǎn)以前蛇族發(fā)明的諾亞神舟?？墒菫榱藛由裰?，必須得到蛇族的幫助。為此，羊羊特工隊(duì)和機(jī)械喜羊羊踏上兇險(xiǎn)莫測的冒險(xiǎn)旅程……
　　本片為《喜羊羊與灰太狼》系列第五部劇場版動畫。